Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nova1Q9JKN6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms