Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx21Q9JIK5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx21Q9JIK5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx21Q9JIK5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms