Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PREBQ9HCU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PREBQ9HCU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms