Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIPK3Q9H422 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK3Q9H422 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms