Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCBP2Q9H190 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCBP2Q9H190 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms