Protein–RNA interactions for Protein: Q9H158

PCDHAC1, Protocadherin alpha-C1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC1Q9H158 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHAC1Q9H158 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHAC1Q9H158 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHAC1Q9H158 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms