Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtofQ9ESF1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtofQ9ESF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms