Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx6Q9ER75 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx6Q9ER75 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx6Q9ER75 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms