Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Clstn2Q9ER65 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn2Q9ER65 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms