Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst4Q9EQW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndst4Q9EQW8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst4Q9EQW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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