Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a1Q9EPE9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a1Q9EPE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms