Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pak1ip1Q9DCE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pak1ip1Q9DCE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms