Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubiad1Q9DC60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms