Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpraQ9DBG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms