Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl4Q9D8E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl4Q9D8E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl4Q9D8E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms