Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2dQ9D7M8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms