Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl40Q9D783 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl40Q9D783 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl40Q9D783 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms