Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MsraQ9D6Y7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MsraQ9D6Y7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms