Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc7Q9D541 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc7Q9D541 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms