Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap53Q9D439 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap53Q9D439 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms