Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933428M09RikQ9D3X3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933428M09RikQ9D3X3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms