Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
5430402E10RikQ9D3N5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430402E10RikQ9D3N5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430402E10RikQ9D3N5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms