Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D3J9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D3J9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D3J9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D3J9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D3J9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms