Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp5Q9D387 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lamp5Q9D387 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp5Q9D387 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms