Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap1Q9D0M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap1Q9D0M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap1Q9D0M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms