Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6kQ9CWP4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6kQ9CWP4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6kQ9CWP4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms