Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhobtb3Q9CTN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhobtb3Q9CTN4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms