Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc43Q9CR29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc43Q9CR29 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms