Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms