Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UPF3BQ9BZI7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms