Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PCGF6Q9BYE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PCGF6Q9BYE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PCGF6Q9BYE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.9 ms