Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC3Q9BY71 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC3Q9BY71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1019.3 ms