Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNHG12Q9BXW3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms