Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARD11Q9BXL7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARD11Q9BXL7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARD11Q9BXL7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARD11Q9BXL7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARD11Q9BXL7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARD11Q9BXL7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARD11Q9BXL7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms