Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYCP2Q9BX26 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYCP2Q9BX26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYCP2Q9BX26 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SYCP2Q9BX26 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms