Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC94Q9BW85 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC94Q9BW85 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms