Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM106CQ9BVX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM106CQ9BVX2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms