Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM29Q9BSF4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM29Q9BSF4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMM29Q9BSF4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMM29Q9BSF4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMM29Q9BSF4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms