Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms