Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rrbp1Q99PL5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rrbp1Q99PL5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rrbp1Q99PL5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms