Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms