Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bco2Q99NF1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bco2Q99NF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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