Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BrapQ99MP8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrapQ99MP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms