Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdpd3Q99LY2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdpd3Q99LY2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms