Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RtcbQ99LF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RtcbQ99LF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RtcbQ99LF4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms