Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TriobpQ99KW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TriobpQ99KW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TriobpQ99KW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms