Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nlgn1Q99K10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nlgn1Q99K10 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nlgn1Q99K10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlgn1Q99K10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlgn1Q99K10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms