Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctu1Q99J10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctu1Q99J10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms