Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3CQ99985 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms