Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL1Q99961 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms